Seiring merebaknya pandemi Covid-19 di Indonesia, kegiatan akademik Program Studi S1 Teknik Informatika ( TI ) Fakultas Sains dan Teknologi UIN Sunan Kalijaga diselenggarakan secara daring. Salah satu dari sekian banyak kegiatan yang diselenggarakan adalah pelaksanaan Munaqosah daring. Penyelenggaraan kegiatan Munaqosah secara daring merupakan salah satu upaya yang dilakukan program studi untuk mengurangi penyebaran pandemi Covid-19 dilingkungan kampus dan khususnya di wilayah provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta. Munaqosah dilaksanakan menggunakan beberapa media konferens seperti Google Meet dan Zoom. Dalam pelaksanaannya, kegiatan munaqosah yang diselenggarakan secara daring hampir sama dengan kegiatan munaqosah sebelum pandemi hanya saja lokasi dan dokumen yang dipersiapkan oleh mahasiswa berupa dokumen digital. Ujian munaqosah dapat berlangsung secara paralel mapupun dalam waktu yang bersamaan bergantung jadwal yang telah disepakati oleh program studi.

Ujian Munaqosah merupakan langkah terakhir yang harus dilewati mahasiswa untuk mendapatkan gelar Strata 1 (S1). Ujian munaqosah dilaksanakan untuk menguji hasil karya/ penelitian yang telah dilaksanakan oleh mahasiswa dalam bidang informatika serta menilai kemampuan mahasiswa dalam berpikir secara interdisipliner. Ujian munaqosah wajib diikuti oleh seluruh mahasiswa S1 yang sudah menempuh seluruh mata kuliah serta dinyatakan lulus sesuai standar kelulusan yang telah ditetapkan.